Universitas Indonesia telah mendapatkan berbagai penghargaan di antaranya :
- Universitas Indonesia tampil di rangking pertama untuk kategori universitas asal Indonesia versi QS dan peringkat 67 Asia pada tahun 2016.
- Universitas Indonesia tampil di rangking pertama untuk kategori universitas asal Indonesia versi QS dan peringkat 79 Asia pada tahun 2015.
- Universitas Indonesia tampil di rangking pertama untuk kategori universitas asal Indonesia versi QS dan peringkat 71 Asia pada tahun 2014.
- Universitas Indonesia tampil di rangking pertama untuk kategori universitas asal Indonesia versi QS dan peringkat 64 Asia pada tahun 2013.
- Universitas Indonesia tampil di rangking pertama untuk kategori universitas asal Indonesia versi QS, peringkat 59 Asia, dan peringkat 273 dunia pada tahun 2012.
- Universitas Indonesia tampil di rangking pertama untuk kategori universitas asal Indonesia versi QS, peringkat 50 Asia, dan peringkat 217 dunia pada tahun 2011.
- Universitas Indonesia tampil di rangking pertama untuk kategori universitas asal Indonesia versi QS dan peringkat 50 Asia pada tahun 2010.
- Universitas Indonesia tampil di rangking pertama untuk kategori universitas asal Indonesia versi THES tahun 2016.
- Universitas Indonesia tampil di rangking pertama untuk kategori universitas asal Indonesia versi THES tahun 2015.
- Universitas Indonesia tampil di rangking pertama untuk kategori universitas asal Indonesia versi THES tahun 2009.
- Universitas Indonesia tampil di rangking pertama untuk kategori universitas asal Indonesia versi THES tahun 2008.
- Universitas Indonesia rangking ke 250 di THES tahun 2006 sebagai Universitas berkelas dunia dan rangking 395 di THES 2007.
- Universitas Indonesia tampil di rangking pertama untuk kategori universitas asal Indonesia versi Webometric dan peringkat 13 Asia Tenggara pada tahun 2016.
- Universitas Indonesia tampil di rangking 3 untuk kategori universitas asal Indonesia versi Webometric pada tahun 2015.
- Universitas Indonesia tampil di rangking 2 untuk kategori universitas asal Indonesia versi Webometric pada tahun 2014.